La differenza tra MOV e MP4 è sottile. Il formato MOV e la sua estensione *.mov è stato creato appositamente da Apple come file da utilizzare con QuickTime, ma poi si è diffuso in molti altri dispositivi. I file MP4 sono stati creati per essere uno standard internazionale, quindi questo tipo di file è ancora più mainstream e diffuso del MOV.
Una differenza è che i file video MP4 tendono a essere compressi in dimensioni più piccole. Questo, unito al fatto che sono più standardizzati e riconosciuti da un numero leggermente maggiore di soluzioni software e hardware, implica che questi file sono utilizzati per lo streaming e altri usi standardizzati.
I file MOV sono stati creati per l'editing video. Di solito sono file piuttosto grandi, quindi per l'archiviazione potrebbero non essere all'altezza degli MP4. La compressione di MP4 mantiene un'enorme quantità di dati all'interno del video.
Per gli utenti Mac, MOV può essere altrettanto semplice da usare quanto MP4, ma il fatto che MP4 abbia una migliore compressione e sia standardizzato su tutte le piattaforme, significa che è la scelta preferita per molti usi professionali. Entrambi sono formati di file con perdita, quindi di solito la compressione è presente in qualsiasi file si scelga. I file MOV possono avere una minore compressione e quindi essere più indicati per mantenere un video di alta qualità, durante il processo di editing.